Дизели В-6М-1 и В-6Р-1 имеют следующие отличия от дизеля В-6Б:

• генератор не устанавливается;
• установочное место привода генератора на верхнем картере закрыто крышкой;
• не устанавливается трубка, соединяющая полость обогрева нижнего картера с водяным насосом;
• на водяном насосе не устанавливается сливной кран, а отверстие глушится пробкой;
• вместо заглушки на блоке у шестого цилиндра устанавливается патрубок для дополнительного отвода охлаждающей жидкости;
• угольник слива охлаждающей жидкости из головки блока несколько измененной конструкции;
• патрубок для слива масла из МЦ-1 развернут в другую сторону;
• применена система принудительного отвода картерных газов, для чего у сапуна на крышке имеется патрубок для подсоединения шланга от воздухоочистителя, а труба слива масла из головки не имеет дополнительного суфлера.