Дизель В-59У имеет следующие отличия от дизеля В-46-6:

• центробежный нагнетатель не устанавливается, а его посадочное место закрывается технологической крышкой;
• со стороны передачи вместо крышки центрального подвода масла установлен механизм отбора мощности;
• для подвода в цилиндры дизеля очищенного воздуха устанавливаются впускные трубопроводы, развернутые горловиной в сторону носка коленчатого вала;
• выпускные трубопроводы устанавливаются соединительными фланцами в сторону носка коленвала и имеют устройство для охлаждения воздухом;
• применена принудительная система вентиляции картера, для этого на маслоотделителе установлена крышка с патрубком для отвода картерных газов через воздухоочиститель;
• установлен генератор типа Г-6,5, который крепится двумя ленточными хомутами к съемному кронштейну верхнего картера;
• привод генератора посредством гидравлической муфты, обеспечивающей гашение крутильных колебаний, возникающих при работе деталей привода;
• угольники слива охлаждающей жидкости из головок блоков измененной конструкции;
• патрубок для подсоединения шланга слива масла из МЦ-1 развернут в другую сторону;
• привод ТНВД осуществляется посредством двухпозиционной муфты с двумя фиксируемыми положениями (положение "ЗИМА" и "ЛЕТО");
• устройство для подсоединения прибора для консервации дизеля не устанавливается;
• слева на нижнем картере установлен патрубок отвода охлаждающей жидкости, направленный в сторону передачи. С правой стороны отверстие нижнего картера глушится пробкой;
• раструб водяного насоса измененной конфигурации.